治疗椎间盘突出症中，减少突出的椎间盘容积是治疗的一个主要目的。臭氧注入椎间盘后能迅速氧化髓核内的蛋白多糖， 同时髓核细胞膜和细胞内结构破坏，造成细胞变性坏死，细胞合 成和分泌蛋白多糖的功能下降或丧失，最终使髓核渗透压降低并 丢失水份，导致了椎间盘容量的减少。从而减轻对神经根的压迫， 减轻静脉淤血，改善局部微循环，增加氧的供应，起到治疗椎间 盘突出和镇痛的作用。

    研究表明，臭氧能引起肺脏代谢改变，对呼吸系统有毒性、特别是上呼吸道纤毛细胞对臭氧敏感，因此无论何种治疗方式都严禁臭氧直接吸人肺内。臭氧还可引起广泛的遗传损伤，具有潜在的遗传毒性。

    臭氧除具有治疗作用外还具有细胞毒性，这种双重作用导致臭氧的应用存在争议。臭氧的浓度难以精确调控使其疗效不稳定，基础研究和循证医学研究不足也是引起争议的重要原因。
1980年德国医学界为此组织了 644位专家对5579238例次医 用臭氧治疗进行了回顾性分析，发现其中40例出现过敏反应等副 作用，发生率为十万分之七，未发现致残死报道。表明用臭氧用于临床是一种比较安全的治疗手段。

    一-般认为，医用臭氧卨浓度（30-70ug/ml)时可导致组织结构破坏，中等浓度（20-30Ug/ml)时主要发挥调节作用，低浓度(<20ug/ml )时主要发挥增加氧供的作用。